De acordo com dados da Prefeitura
Municipal de Nova Xavantina a cidade possui um clima tropical quente e
sub-úmido, com 4 meses de seca, de maio a agosto. Precipitação anual de 1.750
mm, com intensidade máxima em dezembro, janeiro e fevereiro. Temperatura média
anual de 24º C, maior máxima 38º C, menor 0º C.
O relevo de Nova Xavantina, possui uma depressão Araguaia, Serra do
Roncador.